京師，像以往曆次清軍入塞一樣，崇祯帝在軍警解除之後對失事諸臣進行了嚴厲的懲處，由于這一次清軍為害最烈，，這次的懲辦也比以往任何一次都更為嚴酷。

　　到這種時候，崇祯帝才充分表現出他的聰明能幹。
他把文武諸臣的軍事過失分為五大類，分别是“守邊失機”、“殘破城邑”、“失陷藩封”、“失亡主帥”、“擁兵觀望”，統稱叫做“五大法案”。

　　兵部和刑部通過認真審核，确定将薊鎮總監太監鄧希诏、分監太監孫茂霖、順天巡撫陳祖苞、保定巡撫張其平、山東巡撫顔繼祖、山東巡撫倪寵、薊鎮總兵官吳國俊、薊鎮總兵官陳國威、援剿總兵官祖寬、援剿總兵官吳重鎮。

　　以及副将以下直至州縣官員三十六人一同判處死刑，夏日執行。
首席大學士劉宇亮以下等上百名大小官員被遣戌、削籍、罷官、降級。
隻有輔臣兵部尚書楊嗣昌仍然受到信任，沒有受到任何處分。

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　　四月初一，威海衛，一千戶流民已經招募完畢，堡民們自己推舉出三名候選甲長，趙海一一任命了甲長和副甲長，保長與副保長，一千名十六到三十歲的青壯加入了威海營，趙海宣布保長、副保長、甲長、副甲長每畝地租減免一升。

　　被任命為為保長、副保長、甲長、副甲長的三百七十人歡呼起來，而沒有推舉自己的衆人不禁懊悔起來。
趙海繼續宣布，凡是有加入威海營的，每人賞賜一斤蔬菜種子，場下又是一陣歡呼聲。

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