同之前馬尼拉的艦隊不一樣，或許是因為距離太遠的緣故，巴達維亞的聯軍艦隊并不能确定對方什麼時候起航，什麼時候會來，因此多數情況下就将艦隊集中在港口附近，并外出一二十裡的距離上派遣一些巡航船展開巡邏。當西班牙人與南洋海盜的船隊撤退下來之後，港口附近的海上力量也陡然增加了不少。
雲集在港口中的主力艦就多達三十艘，此外還包括六十艘上下噸位還算湊合，至少超過千料規模的武裝商船，并不算大的普通帆船的規模也達到了二百餘艘之多，雖然在菲律賓一帶的海域遭遇到了不少傷亡損失，可是在巴達維亞一帶完成了和規模不小的荷蘭艦隊彙合之後，海上的兵力還是達到了兩萬五千人左右的規模，并擁有七萬噸左右的軍艦與武裝商船。之前的時候因為情報渠道有限的緣故巴達維亞一帶的荷蘭總督并不了解東方人現在海上有可能的家底，當初加來海戰之後雖然各船都針對性的做了很多的準備，可還是心中沒有太大的底子。
撤退過來的西班牙人所說的話巴達維亞的總督并沒有全信，不過對方船隻上的那些破損之處來看，對方的海戰火器确實存在很大的問題。即便如此，巴達維亞總督還是決定以防守戰略為主，當敵軍的船隊來襲之後再同對方展開決戰。畢竟在防守自己已有利益的情況下船員們所能發揮出來的表現其實總是要比主動性的行動要多一些的。畢竟那些強敵的船隊可不是攜帶有不少金銀貨物的貨船。
好在因為西班牙艦隊撤退下來之後威脅臨近的緣故，船上的戰備還算湊合，因此當敵船在海天之間出現之後不到半個小時之内各船就紛紛升起了帆并做好了作戰的準備，海戰的臨時指揮權也由擁有主場優勢而且實力更強的荷蘭人負責。
雖然在以前的時候新教與天主教兩家勢力矛盾重重，不過在面臨前所未有的強敵的時候，也不得不集兵在一起作戰了。撤退下來的那些西班牙與南洋海盜們似乎還算樂觀的情緒也感染了不少人，特别是艦到對方的船隻的确是如傳說中的那樣因為重視防護而航速方面有很多短闆，雖然在臨近夏季的巴達維亞一帶風向也不是特别有利，不過對于海上航行和在旗語之下的組織作戰并不陌生的兩家艦隊來說還是很快形成了有效的協同并從多個方向向目标逼近而去。
在雙方船隊之間的距離逼近到大概兩裡左右距離的時候，還是首先由聯軍艦隊一方首先開炮擊。雖然即便在風浪并不算大的情況下在這個距離上展開炮擊的效果可疑，但毫無疑問對己方的士氣是有很大好處的，似乎仍然在宣稱這一次作戰的主動權乃至誰處于完全被動的一方。
吸取了之前在馬尼拉附近海域上交戰的經驗教訓，這一次為了防止那些線膛炮帶來的威脅，船上不少炮位附近也都勇用糧袋或沙袋做了補充性的防護，并且在火力展開的時候，炮手以外的人員也大多蜷縮身子避免傷亡。據說那些東方強敵的炮火雖然對船體的殺傷力不大，可最重要的卻是對人員的殺傷。
聯軍在兩裡左右距離上的開火雖然在王遠所率領的主力船團的前後左右乃至陣列之中飛濺起來不少看起來如同水雷爆炸一樣的水柱，但命中船隻的炮彈卻寥寥，加上此時船隊之中已經沒有防護力薄弱的船隻因此基本沒有帶來什麼影響。
面對聯軍艦隊以優勢火力展開的挑釁，王遠并沒有下令立即展開火力還擊。很多作戰預案在商議的時候也同各艦艦長确定下來。雖然此時主力艦隊的航速已經同過去根本不同了，可是如果敵人打算拼命逃脫，數量并不多的主力艦隊在力求殲滅對手方面還是會遇到很大的問題。隻有在近距離的鏖戰中給對方一定的消耗之後突然發難展開合圍攻擊，才有最終打破局面的可能。
就這樣，單方面的炮擊也讓一開始有些謹慎的荷蘭艦隊變得越來越大膽起來，雙方之間的距離也似乎在單方面的炮擊之中越來越近。
這一次，面對那些挂甲船擺開的環陣，聯軍艦隊再一次從四面八方圍攏過來，并且雲集了至少二十艘主力艦與三十艘大型武裝商船集中起近千門中重火炮逼近到一裡左右的距離上針對十五艘挂甲船展開了接連不斷的轟擊。
或許是海上的風浪并不算大的緣故，在這個以往在海戰中根本無法有效命中的距離上，也還發揮出了似乎讓人能夠勉強接受的命中率，連綿不斷的半個小時内的二十輪開火，近兩萬發炮彈的轟擊之下，命中西面聯軍艦隊集中攻擊方向十五艘船船身的炮彈就多達八九百枚之多，個别船身上被命中的炮彈多達上百發。不過即便是如此，似乎仍然沒有帶來太大的威脅。
負責指揮艦隊聯軍艦隊的旗船下達了以重霰彈展開火力壓制對手，逼近到更近距離上以猛烈的重臼炮火力擊沉對手若幹艘戰艦的決心，在聯軍艦隊逼近到了二百步左右距離上的時候，忍耐多時的船上的官兵也紛紛以輕型線膛炮乃至不少臨時裝備在艦上的三兩彈铳炮展開了接連不斷的攢射。
風浪并不算很大的情況下，幾乎發射出去的彈丸在二百多步的距離上有一半左右命中了敵船，三百門線膛炮在短短幾分鐘時間内展開的兩千多發彈丸就讓上千發兩斤左右的重彈鑽入了敵船之中，不過或許是早就有了防禦中的準備，這些彈丸對敵船的人員殺傷效果似乎也大不如前起來。
在逼近到百步左右距離上的時候，船隊開始稍稍的展開了向後的收縮與撤退，命中船舷的敵炮彈也越來越多起來，時不時鑽入炮窗的重霰彈也開會造成了不少艦内官兵的傷亡，戰局似乎已經向着有利于聯軍的方向發展。